Обновленная игровая система не препятствует игрокам устраивать публичные казни целых отрядов противников. Сэму Фишеру теперь не стоит сидеть в укрытии, а воевать в полном объёме. Реальное подключение авиационных ударов. Допустимо скрытное штудирование миссий. Присутствует 3 стиля: 1. «Призрак» - не убий; 2. «Пантера» - полная ликвидация; 3. «Штурм» - открытый бой. После событий «Конвикшен» прошло 6 месяцев. Распущен « 3 эшелон». Соединённым Штатам Америки угрожают террористы из Азии. Если Америка не положит конец своей интервенции в данной стране, то теракты с их стороны будут прекращены. Смертниками был создан «Чёрный список», в нём прописаны угрозы, которые непременно станут явью, если требования не будут выполнены. Президент Америки обратился за помощью к Сэму. Агент не отказал в просьбе, а наоборот, сформировывает « 4 эшелон». А в качестве помощницы становится его боевая подруга - Анна Гримсдоттир . Сэму поступило важное сообщение от правителя Америки, тем самым, он вручает «5 свободу», и встать на защиту всех четырёх.